ideipro logotyp

От данных к открытиям: закулисье биоинформатического хакатона

Автор: сотрудники Bio-IT World

1 апреля 2026 г. | В эпоху, когда исследования генерируют больше данных, чем когда-либо прежде, всё чаще встаёт вопрос: как учёные могут на самом деле использовать эти данные? Организаторы Bio-IT World Hackathon считают, что ответ кроется не только в улучшении инструментов, но и в улучшении сотрудничества — и всё чаще в разумном использовании искусственного интеллекта.

Аллисса Диллман, основатель и генеральный директор BioData Sage, и ЛаФрэнсис Гибсон, менеджер по продвижению здорового образа жизни в ORAU, уже много лет проводят хакатон Bio-IT World от имени Учебного центра экосистемы данных Общего фонда Национальных институтов здравоохранения (NIH) (CFDE). В новом выпуске подкаста Trends from the Trenches с ведущей Эллисон Проффитт они обсуждают, как хакатон объединяет самых разных участников — специалистов по обработке данных, разработчиков программного обеспечения и профессионалов в области биологических наук — для интенсивной работы над реальными задачами в области биомедицинских данных. Но в отличие от традиционных соревнований по программированию, это мероприятие целенаправленно построено вокруг трех взаимосвязанных целей: создание, обучение и сотрудничество.

Учебный центр CFDE — это масштабная инициатива, включающая в себя разнообразный набор баз данных, наборов данных, инструментов и ресурсов из различных биомедицинских программ. Доступные участникам наборы данных охватывают широкий спектр областей, включая геномику и фенотипы.

Хакатон организован по шести направлениям, и участники могут выбрать, какое из них они хотели бы изучить подробнее.

  • Проект 1: Физические упражнения как лекарство: Противоположные молекулярные признаки в здоровье и болезни
  • Проект 2: Перепрофилирование лекарственных препаратов на основе сходства заболеваний и сетей биомаркеров.
  • Проект 3: Визуализированные нейронные сети для оценки реакции на противораковые препараты (CellMap-VNN)
  • Проект 4: Изучение молекулярных основ побочных эффектов лекарственных препаратов
  • Проект 5: Анализ данных о посттрансляционных модификациях в базе данных CFDE.
  • Проект 6: Выявление имитации физических упражнений с помощью моделей Gene Set Foundation.

Хакатон также предоставляет доступ к облачным вычислительным средам, позволяя участникам анализировать большие наборы данных без ограничений локальной инфраструктуры. Такая организация работы особенно важна, учитывая сжатые сроки. У команд есть всего 48 часов на разработку рабочей концепции, прототипа или анализа.

Вторичные результаты

Но здесь есть и второстепенная исследовательская цель. В дополнение к вопросам и наборам данных, изложенным в шести проектах, организаторы планируют изучить фундаментальные вопросы командного взаимодействия с использованием ИИ.

«Нам очень интересно посмотреть, как разные люди с разным опытом используют ИИ, — сказал Диллман. — Чем это отличается? Как они в итоге объединяются и собирают воедино все эти разные элементы?»

Чтобы ответить на эти вопросы, организаторы будут наблюдать за рабочими процессами команд в общих облачных средах, анализировать взаимодействие с инструментами ИИ и проводить интервью во время и после мероприятия. Цель состоит в том, чтобы лучше понять не только индивидуальное использование ИИ, но и то, как команды коллективно проверяют, корректируют и обобщают результаты, полученные с помощью ИИ.

Хакатон открыт для участников всех уровней, от студентов до профессионалов отрасли, и участие в нем бесплатное. Мероприятие призвано снизить барьеры и расширить круг участников.

«Данные оказывают влияние только в том случае, если люди могут ими пользоваться», — сказал Гибсон. «Именно здесь мы надеемся преодолеть этот разрыв и позволить людям по-настоящему погрузиться в эту область».

Чтобы узнать больше о том, как принципы FAIR влияют на хакатон, как зарегистрироваться и какие призы могут выиграть участники, послушайте подкаст Trends from the Trenches. Также обязательно зарегистрируйтесь на конференцию и выставку Bio-IT World Conference & Expo, где состоится хакатон.

Источник: www.bio-itworld.com

✅ Найденные теги: Биоинформатика, Данные, новости, От, Открытия, Хакатон

ОСТАВЬТЕ СВОЙ КОММЕНТАРИЙ

Каталог бесплатных опенсорс-решений, которые можно развернуть локально и забыть о подписках

галерея

Изображение ДНК и мозга на цветном фоне, символизирующее генетические исследования.
Компания Route 92 Medical привлекла 50 миллионов долларов для поддержки своей стратегии роста.
Интерфейс приложения для общения на экране смартфонов.
Коробчатые диаграммы данных для субъектов 1-4, сравнение значений.
От складывания коробок до ремонта пылесосов, роботизированная модель GEN-1 демонстрирует 99% надежность.
Ноутбук и смартфон с интерфейсом ChatGPT на фиолетовом фоне.
ideipro logotyp
ideipro logotyp
Женщина в свитере с телефоном, стол с калькулятором и бумагами, кофейный стакан.
Image Not Found
Изображение ДНК и мозга на цветном фоне, символизирующее генетические исследования.

Генная мутация может застревать в мозге пациентов с шизофренией в искаженной реальности.

Генная мутация, связанная с шизофренией, может нарушать способность мозга адаптироваться к новой информации, что приводит к ригидному, устаревшему мышлению. Изображение: Shutterstock Одной из распространенных особенностей шизофрении является трудность в использовании новой информации для понимания окружающего мира. Эта…

Апр 8, 2026
Компания Route 92 Medical привлекла 50 миллионов долларов для поддержки своей стратегии роста.

Компания Route 92 Medical привлекла 50 миллионов долларов для поддержки своей стратегии роста.

В портфолио нейроваскулярных решений Route 92 входит система реперфузии HiPoint для лечения острого ишемического инсульта. Фото: mi_viri / Shutterstock.com. Компания Route 92 Medical привлекла 50 миллионов долларов финансирования для поддержки следующего этапа своей стратегии развития. В раунде…

Апр 8, 2026
Интерфейс приложения для общения на экране смартфонов.

STAT+: Компания Jimini Health привлекла финансирование для разработки чат-бота на основе искусственного интеллекта, предназначенного для оказания комплексной помощи в области психического здоровья.

Стартап, привлекший 17 миллионов долларов инвестиций, стремится поддержать поставщиков услуг, а не заменить их. Управление оповещениями для этой статьи Отправить эту статью по электронной почте Поделитесь этой статьей Джимини Здоровье Чат-боты могут общаться как терапевты, но стоит…

Апр 8, 2026
Коробчатые диаграммы данных для субъектов 1-4, сравнение значений.

Массовое распространение азитромицина и антибиотикорезистентность в кишечнике и носоглотке: кластерное рандомизированное исследование.

Абстрактный Повторное полугодовое массовое применение азитромицина у детей показало свою эффективность в снижении общей детской смертности. Однако устойчивость к антибиотикам является серьезной проблемой общественного здравоохранения, поскольку эта программа реализуется в странах Африки к югу от Сахары. В…

Апр 8, 2026

Впишите свой почтовый адрес и мы будем присылать вам на почту самые свежие новости в числе самых первых