ideipro logotyp

От данных к открытиям: закулисье биоинформатического хакатона

Автор: сотрудники Bio-IT World

1 апреля 2026 г. | В эпоху, когда исследования генерируют больше данных, чем когда-либо прежде, всё чаще встаёт вопрос: как учёные могут на самом деле использовать эти данные? Организаторы Bio-IT World Hackathon считают, что ответ кроется не только в улучшении инструментов, но и в улучшении сотрудничества — и всё чаще в разумном использовании искусственного интеллекта.

Аллисса Диллман, основатель и генеральный директор BioData Sage, и ЛаФрэнсис Гибсон, менеджер по продвижению здорового образа жизни в ORAU, уже много лет проводят хакатон Bio-IT World от имени Учебного центра экосистемы данных Общего фонда Национальных институтов здравоохранения (NIH) (CFDE). В новом выпуске подкаста Trends from the Trenches с ведущей Эллисон Проффитт они обсуждают, как хакатон объединяет самых разных участников — специалистов по обработке данных, разработчиков программного обеспечения и профессионалов в области биологических наук — для интенсивной работы над реальными задачами в области биомедицинских данных. Но в отличие от традиционных соревнований по программированию, это мероприятие целенаправленно построено вокруг трех взаимосвязанных целей: создание, обучение и сотрудничество.

Учебный центр CFDE — это масштабная инициатива, включающая в себя разнообразный набор баз данных, наборов данных, инструментов и ресурсов из различных биомедицинских программ. Доступные участникам наборы данных охватывают широкий спектр областей, включая геномику и фенотипы.

Хакатон организован по шести направлениям, и участники могут выбрать, какое из них они хотели бы изучить подробнее.

  • Проект 1: Физические упражнения как лекарство: Противоположные молекулярные признаки в здоровье и болезни
  • Проект 2: Перепрофилирование лекарственных препаратов на основе сходства заболеваний и сетей биомаркеров.
  • Проект 3: Визуализированные нейронные сети для оценки реакции на противораковые препараты (CellMap-VNN)
  • Проект 4: Изучение молекулярных основ побочных эффектов лекарственных препаратов
  • Проект 5: Анализ данных о посттрансляционных модификациях в базе данных CFDE.
  • Проект 6: Выявление имитации физических упражнений с помощью моделей Gene Set Foundation.

Хакатон также предоставляет доступ к облачным вычислительным средам, позволяя участникам анализировать большие наборы данных без ограничений локальной инфраструктуры. Такая организация работы особенно важна, учитывая сжатые сроки. У команд есть всего 48 часов на разработку рабочей концепции, прототипа или анализа.

Вторичные результаты

Но здесь есть и второстепенная исследовательская цель. В дополнение к вопросам и наборам данных, изложенным в шести проектах, организаторы планируют изучить фундаментальные вопросы командного взаимодействия с использованием ИИ.

«Нам очень интересно посмотреть, как разные люди с разным опытом используют ИИ, — сказал Диллман. — Чем это отличается? Как они в итоге объединяются и собирают воедино все эти разные элементы?»

Чтобы ответить на эти вопросы, организаторы будут наблюдать за рабочими процессами команд в общих облачных средах, анализировать взаимодействие с инструментами ИИ и проводить интервью во время и после мероприятия. Цель состоит в том, чтобы лучше понять не только индивидуальное использование ИИ, но и то, как команды коллективно проверяют, корректируют и обобщают результаты, полученные с помощью ИИ.

Хакатон открыт для участников всех уровней, от студентов до профессионалов отрасли, и участие в нем бесплатное. Мероприятие призвано снизить барьеры и расширить круг участников.

«Данные оказывают влияние только в том случае, если люди могут ими пользоваться», — сказал Гибсон. «Именно здесь мы надеемся преодолеть этот разрыв и позволить людям по-настоящему погрузиться в эту область».

Чтобы узнать больше о том, как принципы FAIR влияют на хакатон, как зарегистрироваться и какие призы могут выиграть участники, послушайте подкаст Trends from the Trenches. Также обязательно зарегистрируйтесь на конференцию и выставку Bio-IT World Conference & Expo, где состоится хакатон.

Источник: www.bio-itworld.com

✅ Найденные теги: Биоинформатика, Данные, новости, От, Открытия, Хакатон

ОСТАВЬТЕ СВОЙ КОММЕНТАРИЙ

Каталог бесплатных опенсорс-решений, которые можно развернуть локально и забыть о подписках

галерея

Мужчина в очках и с короткой стрижкой сидит рядом с окном и наслаждается солнечным светом.
Карта памяти SanDisk Extreme PRO 2TB на столе перед черным кейсом.
Космонавт работает на борту космической станции, окружённый оборудованием и проводами.
Древний океан с причудливыми существами эдиакарского периода на дне.
Капли дождя падают на землю, образуя брызги на мокрой почве.
Капли дождя падают на землю, создавая брызги на мокрой почве.
Вид на Землю из космоса через иллюминатор с силуэтом наблюдающего человека.
Робот-гуманоид Tesla с черной головой и белым туловищем на фоне.
Два персонажа сражаются световыми мечами на темном фоне сцены из фильма.
Image Not Found
Мужчина в очках и с короткой стрижкой сидит рядом с окном и наслаждается солнечным светом.

Как сохранить молодость и увеличить продолжительность жизни?!

Вопрос сохранения молодости и увеличения продолжительности жизни — это, наверное, одна из главных целей современной науки и философии. Сейчас мы подходим к этому не с точки зрения магии, а с точки зрения биохакинга, доказательной медицины и понимания…

Апр 9, 2026
Карта памяти SanDisk Extreme PRO 2TB на столе перед черным кейсом.

Карта памяти SanDisk Extreme Pro UHS-II на 2 Тбайта оценена в $2000

SanDisk незаметно выпустила более ёмкостную версию своей карты памяти Extreme Pro UHS-II, но привлекла она внимание не возможностями, которые мы всё же затронем, а ценником, который выглядит крайне неприятно. Согласно страничке на Amazon, новинка имеет интерфейс SDXC…

Апр 9, 2026
Вид на Землю из космоса через иллюминатор с силуэтом наблюдающего человека.

Сегодня астронавты миссии «Артемида-2» установят новый рекорд расстояния от Земли.

Во время полета космического корабля «Орион» вокруг Луны экипаж «Артемиды II» побьет рекорд, установленный «Аполлоном-13» в 1970 году. Эндрю Лишевски, старший репортер отдела новостей. Публикации этого автора будут добавляться в вашу ежедневную рассылку по электронной почте и…

Апр 9, 2026
Археологическая находка: каменная гробница и скелет в древнем сооружении.

Исследование древнего индивида из Переславля-Залесского указало на его генетически смешанное происхождение

саркофаг V и погребение: А – вид с востока; Б – саркофаг V после снятия погребения и поздней плиты, вид сверху. © ИОГен РАН Археогенетическое исследование погребения из саркофага XIV-XV века в Спасо-Преображенском соборе в Переславле-Залесском показало,…

Апр 9, 2026

Впишите свой почтовый адрес и мы будем присылать вам на почту самые свежие новости в числе самых первых