ideipro logotyp

От данных к открытиям: закулисье биоинформатического хакатона

Автор: сотрудники Bio-IT World

1 апреля 2026 г. | В эпоху, когда исследования генерируют больше данных, чем когда-либо прежде, всё чаще встаёт вопрос: как учёные могут на самом деле использовать эти данные? Организаторы Bio-IT World Hackathon считают, что ответ кроется не только в улучшении инструментов, но и в улучшении сотрудничества — и всё чаще в разумном использовании искусственного интеллекта.

Аллисса Диллман, основатель и генеральный директор BioData Sage, и ЛаФрэнсис Гибсон, менеджер по продвижению здорового образа жизни в ORAU, уже много лет проводят хакатон Bio-IT World от имени Учебного центра экосистемы данных Общего фонда Национальных институтов здравоохранения (NIH) (CFDE). В новом выпуске подкаста Trends from the Trenches с ведущей Эллисон Проффитт они обсуждают, как хакатон объединяет самых разных участников — специалистов по обработке данных, разработчиков программного обеспечения и профессионалов в области биологических наук — для интенсивной работы над реальными задачами в области биомедицинских данных. Но в отличие от традиционных соревнований по программированию, это мероприятие целенаправленно построено вокруг трех взаимосвязанных целей: создание, обучение и сотрудничество.

Учебный центр CFDE — это масштабная инициатива, включающая в себя разнообразный набор баз данных, наборов данных, инструментов и ресурсов из различных биомедицинских программ. Доступные участникам наборы данных охватывают широкий спектр областей, включая геномику и фенотипы.

Хакатон организован по шести направлениям, и участники могут выбрать, какое из них они хотели бы изучить подробнее.

  • Проект 1: Физические упражнения как лекарство: Противоположные молекулярные признаки в здоровье и болезни
  • Проект 2: Перепрофилирование лекарственных препаратов на основе сходства заболеваний и сетей биомаркеров.
  • Проект 3: Визуализированные нейронные сети для оценки реакции на противораковые препараты (CellMap-VNN)
  • Проект 4: Изучение молекулярных основ побочных эффектов лекарственных препаратов
  • Проект 5: Анализ данных о посттрансляционных модификациях в базе данных CFDE.
  • Проект 6: Выявление имитации физических упражнений с помощью моделей Gene Set Foundation.

Хакатон также предоставляет доступ к облачным вычислительным средам, позволяя участникам анализировать большие наборы данных без ограничений локальной инфраструктуры. Такая организация работы особенно важна, учитывая сжатые сроки. У команд есть всего 48 часов на разработку рабочей концепции, прототипа или анализа.

Вторичные результаты

Но здесь есть и второстепенная исследовательская цель. В дополнение к вопросам и наборам данных, изложенным в шести проектах, организаторы планируют изучить фундаментальные вопросы командного взаимодействия с использованием ИИ.

«Нам очень интересно посмотреть, как разные люди с разным опытом используют ИИ, — сказал Диллман. — Чем это отличается? Как они в итоге объединяются и собирают воедино все эти разные элементы?»

Чтобы ответить на эти вопросы, организаторы будут наблюдать за рабочими процессами команд в общих облачных средах, анализировать взаимодействие с инструментами ИИ и проводить интервью во время и после мероприятия. Цель состоит в том, чтобы лучше понять не только индивидуальное использование ИИ, но и то, как команды коллективно проверяют, корректируют и обобщают результаты, полученные с помощью ИИ.

Хакатон открыт для участников всех уровней, от студентов до профессионалов отрасли, и участие в нем бесплатное. Мероприятие призвано снизить барьеры и расширить круг участников.

«Данные оказывают влияние только в том случае, если люди могут ими пользоваться», — сказал Гибсон. «Именно здесь мы надеемся преодолеть этот разрыв и позволить людям по-настоящему погрузиться в эту область».

Чтобы узнать больше о том, как принципы FAIR влияют на хакатон, как зарегистрироваться и какие призы могут выиграть участники, послушайте подкаст Trends from the Trenches. Также обязательно зарегистрируйтесь на конференцию и выставку Bio-IT World Conference & Expo, где состоится хакатон.

Источник: www.bio-itworld.com

✅ Найденные теги: Биоинформатика, Данные, новости, От, Открытия, Хакатон

ОСТАВЬТЕ СВОЙ КОММЕНТАРИЙ

Каталог бесплатных опенсорс-решений, которые можно развернуть локально и забыть о подписках

галерея

Вид на Землю из космоса через иллюминатор с силуэтом наблюдающего человека.
Робот-гуманоид Tesla с черной головой и белым туловищем на фоне.
Два персонажа сражаются световыми мечами на темном фоне сцены из фильма.
Археологическая находка: каменная гробница и скелет в древнем сооружении.
Автоматизация программирования на Python: конвейеры, графики и код.
Два человека пожимают руки на фоне синего логотипа компании.
Схематичное изображение человеческого мозга на фоне компьютерных технологий.
Блинчики с сахарной пудрой и черникой на серой тарелке, десерт на завтрак.
Изображение ДНК и мозга на цветном фоне, символизирующее генетические исследования.
Image Not Found
Вид на Землю из космоса через иллюминатор с силуэтом наблюдающего человека.

Сегодня астронавты миссии «Артемида-2» установят новый рекорд расстояния от Земли.

Во время полета космического корабля «Орион» вокруг Луны экипаж «Артемиды II» побьет рекорд, установленный «Аполлоном-13» в 1970 году. Эндрю Лишевски, старший репортер отдела новостей. Публикации этого автора будут добавляться в вашу ежедневную рассылку по электронной почте и…

Апр 9, 2026
Археологическая находка: каменная гробница и скелет в древнем сооружении.

Исследование древнего индивида из Переславля-Залесского указало на его генетически смешанное происхождение

саркофаг V и погребение: А – вид с востока; Б – саркофаг V после снятия погребения и поздней плиты, вид сверху. © ИОГен РАН Археогенетическое исследование погребения из саркофага XIV-XV века в Спасо-Преображенском соборе в Переславле-Залесском показало,…

Апр 9, 2026
Автоматизация программирования на Python: конвейеры, графики и код.

Создание рабочего процесса на Python, который выявляет ошибки до запуска в производство.

Использование современных инструментов для выявления дефектов на более ранних этапах жизненного цикла программного обеспечения. Делиться Python — один из тех языков, который позволяет почувствовать себя продуктивным практически мгновенно. В этом во многом и заключается его популярность. Переход…

Апр 9, 2026
Два человека пожимают руки на фоне синего логотипа компании.

Intel присоединяется к проекту Илона Маска по производству чипов Terafab.

Вкратце Источник изображения: Intel (откроется в новом окне) Компания Intel присоединится к SpaceX и Tesla в стремлении построить новый завод по производству полупроводников в США, в штате Техас, хотя масштабы ее вклада пока неясны. «Наша способность проектировать,…

Апр 8, 2026

Впишите свой почтовый адрес и мы будем присылать вам на почту самые свежие новости в числе самых первых