ideipro logotyp

От данных к открытиям: закулисье биоинформатического хакатона

Автор: сотрудники Bio-IT World

1 апреля 2026 г. | В эпоху, когда исследования генерируют больше данных, чем когда-либо прежде, всё чаще встаёт вопрос: как учёные могут на самом деле использовать эти данные? Организаторы Bio-IT World Hackathon считают, что ответ кроется не только в улучшении инструментов, но и в улучшении сотрудничества — и всё чаще в разумном использовании искусственного интеллекта.

Аллисса Диллман, основатель и генеральный директор BioData Sage, и ЛаФрэнсис Гибсон, менеджер по продвижению здорового образа жизни в ORAU, уже много лет проводят хакатон Bio-IT World от имени Учебного центра экосистемы данных Общего фонда Национальных институтов здравоохранения (NIH) (CFDE). В новом выпуске подкаста Trends from the Trenches с ведущей Эллисон Проффитт они обсуждают, как хакатон объединяет самых разных участников — специалистов по обработке данных, разработчиков программного обеспечения и профессионалов в области биологических наук — для интенсивной работы над реальными задачами в области биомедицинских данных. Но в отличие от традиционных соревнований по программированию, это мероприятие целенаправленно построено вокруг трех взаимосвязанных целей: создание, обучение и сотрудничество.

Учебный центр CFDE — это масштабная инициатива, включающая в себя разнообразный набор баз данных, наборов данных, инструментов и ресурсов из различных биомедицинских программ. Доступные участникам наборы данных охватывают широкий спектр областей, включая геномику и фенотипы.

Хакатон организован по шести направлениям, и участники могут выбрать, какое из них они хотели бы изучить подробнее.

  • Проект 1: Физические упражнения как лекарство: Противоположные молекулярные признаки в здоровье и болезни
  • Проект 2: Перепрофилирование лекарственных препаратов на основе сходства заболеваний и сетей биомаркеров.
  • Проект 3: Визуализированные нейронные сети для оценки реакции на противораковые препараты (CellMap-VNN)
  • Проект 4: Изучение молекулярных основ побочных эффектов лекарственных препаратов
  • Проект 5: Анализ данных о посттрансляционных модификациях в базе данных CFDE.
  • Проект 6: Выявление имитации физических упражнений с помощью моделей Gene Set Foundation.

Хакатон также предоставляет доступ к облачным вычислительным средам, позволяя участникам анализировать большие наборы данных без ограничений локальной инфраструктуры. Такая организация работы особенно важна, учитывая сжатые сроки. У команд есть всего 48 часов на разработку рабочей концепции, прототипа или анализа.

Вторичные результаты

Но здесь есть и второстепенная исследовательская цель. В дополнение к вопросам и наборам данных, изложенным в шести проектах, организаторы планируют изучить фундаментальные вопросы командного взаимодействия с использованием ИИ.

«Нам очень интересно посмотреть, как разные люди с разным опытом используют ИИ, — сказал Диллман. — Чем это отличается? Как они в итоге объединяются и собирают воедино все эти разные элементы?»

Чтобы ответить на эти вопросы, организаторы будут наблюдать за рабочими процессами команд в общих облачных средах, анализировать взаимодействие с инструментами ИИ и проводить интервью во время и после мероприятия. Цель состоит в том, чтобы лучше понять не только индивидуальное использование ИИ, но и то, как команды коллективно проверяют, корректируют и обобщают результаты, полученные с помощью ИИ.

Хакатон открыт для участников всех уровней, от студентов до профессионалов отрасли, и участие в нем бесплатное. Мероприятие призвано снизить барьеры и расширить круг участников.

«Данные оказывают влияние только в том случае, если люди могут ими пользоваться», — сказал Гибсон. «Именно здесь мы надеемся преодолеть этот разрыв и позволить людям по-настоящему погрузиться в эту область».

Чтобы узнать больше о том, как принципы FAIR влияют на хакатон, как зарегистрироваться и какие призы могут выиграть участники, послушайте подкаст Trends from the Trenches. Также обязательно зарегистрируйтесь на конференцию и выставку Bio-IT World Conference & Expo, где состоится хакатон.

Источник: www.bio-itworld.com

✅ Найденные теги: Биоинформатика, Данные, новости, От, Открытия, Хакатон

ОСТАВЬТЕ СВОЙ КОММЕНТАРИЙ

Каталог бесплатных опенсорс-решений, которые можно развернуть локально и забыть о подписках

галерея

Запуск космической ракеты в небо, огненные струи.
Запуск ракеты с усилителями в космос на фоне голубого неба.
Шмель пьет каплю воды с поверхности.
Шмель пьет каплю воды с гладкой поверхности крупным планом.
Клавиша с надписью "Job change" на серой клавиатуре, символизирующая смену работы.
Клавиша клавиатуры с надписью "Job change" символизирует смену работы.
Подводный древний город с руинами и лестницами на морском дне.
Портрет женщины с длинными волосами в синих тонах на светлом фоне.
Лунный пейзаж с луноходом на поверхности в невесомости, исследование космоса.
Image Not Found
Портрет женщины с длинными волосами в синих тонах на светлом фоне.

Непрерывный мониторинг уровня глюкозы сводил меня с ума.

Компания MAHA одержима этими носимыми устройствами — и делает это по совершенно неправильным причинам. Виктория Сонг, старший рецензент в области носимых технологий. Публикации этого автора будут добавляться в вашу ежедневную рассылку по электронной почте и в ленту…

Апр 8, 2026
Полупрозрачный бокоплав на черном фоне, вид сбоку.

«Не пара»: бокоплавы оказались способны полностью истребить веслоногих рачков в соленых озерах

Гаммарус © Владимир Яковенко / Из личного архива Ученые выяснили, что два вида рачков — бокоплавы и копеподы, — обитающие в гиперсоленых озерах и специально выращиваемые в аквакультурах, не могут жить вместе долгое время. Это связано с…

Апр 8, 2026
Диаграмма двух методов получения кополимеров: автоклавный и высокое давление.

Материалы для водородной энергетики можно будет создавать быстрее

© Алексей Винюков/ФИЦ ПХФ и МХ РАН Исследователи из Московского центра перспективных исследований, НИТУ МИСИС и ФИЦ проблем химической физики и медицинской химии РАН сравнили два способа приготовления дисперсий перфторированных сульфокислотных иономеров — Nafion и Aquivion, которые…

Апр 8, 2026
Пайплайн отбора признаков: корреляция Спирмена и Крамера, отбор финального набора данных.

Создание надежных моделей кредитного скоринга с помощью Python

Практическое руководство по измерению взаимосвязей между переменными для отбора признаков в системе кредитного скоринга. Делиться Спасибо за ваши отзывы и интерес к моей предыдущей статье. Поскольку несколько читателей спрашивали, как воспроизвести анализ, я решил поделиться полным кодом…

Апр 8, 2026

Впишите свой почтовый адрес и мы будем присылать вам на почту самые свежие новости в числе самых первых